Principalele prevederi ale programului "genomul uman"

când a creat programul „genomului uman“, au fost identificate cele trei obiective principale ale acestui program: crearea hărții genetice exacte, crearea unei hărți fizice a genomului uman si a etapelor( determinarea) întregul genom uman.

Crearea harta

genomului genetice harta genetica exactă poate fi creată dacă următoarele două condiții: detectarea în genomul unui număr mare de( diverse) markeri genetici polimorfici și prezența unui număr suficient de familii pentru analiza legăturii dintre acești markeri și stabilirea acordului lor reciproce. Problema markerilor genetici a fost rezolvată după detectarea diferitelor tipuri de polimorfisme ADN.Ordinea introducerii lor de a analiza genetica a fost descoperit prin polimorfismul lungimii fragmentelor de restricție( RFLP pentru scurt), apoi polimorfismul datorită variației numărului de repetiții în tandem( VNTR-polimorfism).Fiecare dintre aceste specii are avantajele și dezavantajele sale, dar toate împreună permit etichetarea genomului unei persoane cu densitate foarte mare.

Chiar și primele 4 tipuri de polimorfisme au permis crearea unei imagini genetice a genomului uman. Setați poziția relativă a marcatorilor a permis o colecție sau o bancă a liniilor celulare obținute de la toți membrii mai multor sute de familii care au inclus cel puțin trei generații. Această bancă de linii celulare a fost creată în Franța pentru a studia polimorfismul în sistemul HLA și a fost foarte utilă pentru cartografierea genetică a genomului uman. După fiecare cromozom a fost cartografiat și a găsit poziția relativă a 10-15 markeri polimorfi, care lucreaza cu markeri succesive a fost realizată pe un material obținut din membrii acestor familii.

Crearea de hărți fizice ale genomului Pentru a crea o harta fizica a genomului, fragmentele donate ale genomului uman, de asemenea, a trebuit să marcheze. Acest lucru a fost realizat cu ajutorul secvențelor scurte( segmente ADN cu o anumită secvență), așa numitul STS, localizarea cromozomului fiind exact cunoscută.STS sunt ușor identificate prin reacția în lanț a polimerazei( PCR).A primit mai mult de 50 000 STS.împrăștiate de-a lungul genomului, iar timpul de cartografiere fizică se stabilește atunci când dispunerea reciprocă a fragmentelor de ADN din biblioteci genomice utilizate ca markeri STS suprapun segmente ADN.definiția

a

genomului uman Mai jos vom rezuma principalele rezultate ale „proiectul de versiune“ a genomului uman, care, după cum sa menționat mai sus, au fost publicate in numarul din februarie al revistei «Nature» în 2001 termenul

„proiectul“ se referă în primul rând la faptulcă definiția genomului continuă.În legătură cu aceasta, în prezent, studiile nu pot fi aranjate în ordine și orientate în multe secvențe mici secvențializate. Incompletența secvenței, în mod firesc, creează probleme pentru identificarea genelor de boli ereditare, gene unice și alte structuri genetice.

Trebuie remarcat faptul că în ultimul trimestru al secolului XX.Genome de virusuri 599 și alte microorganisme, precum și macroorganisme( animale) au fost secvențiate. Experiența dobândită ca rezultat al acestei lucrări a fost pe deplin utilizată în secvențializarea genomului uman. Strategia de învățare

genomului uman in proiect publice include obținerea hărților genetice și fizice ale genomului uman, introducerea ulterioară a acestor carduri rezultate ale secvențierea clonelor individuale ale ADN-ului genomic( secvențierea „clona de clona“ strategie).Harta fizică a genomului uman are o bază clonală, dezvoltată de omul de știință Olson în 1981. Abordarea este după cum urmează.Genomul a fost tăiat în segmente prin digestie parțială cu endonucleaze specifice enzimei. Aceste segmente mari de ADN au fost plasate în cromozom artificial bacterian( BAC) și introdus în bacterii, în cazul în care acestea sunt copiate la fiecare diviziune bacterii. Ca rezultat, s-au format clone de molecule ADN identice. Astfel de clone care acoperă genomul uman ar trebui să fie de aproximativ 20 000.

În plus, cardurile STS dezvoltate anterior au fost utilizate pentru a stabili ordinea clonelor. Rezultatul este o hartă fizică a genomului. Clonele BAC individuale au fost tăiate în fragmente și clonate. Subclonele obținute ca urmare a fragmentelor de clonare au fost studiate. De fiecare dată determinată de un număr mare de subclone identice pentru a fi siguri că fiecare bucată de clone originale BAC analizate de mai multe ori și erori nu sunt permise. Secvențele fragmentelor individuale au fost combinate pentru a obține o secvență de nucleotide în fiecare clonă inițială BAC.În final, secvența întregului genom a fost colectată prin combinarea secvențelor setului BAC care se suprapune întregului genom. Harta astfel creată a secvenței genomului uman are peste 1000 de discontinuități. Acest lucru se poate datora mai multe motive, în special faptului că clonele originale BAC care acoperă întregul genom, precum suprapunerea dintre clone au fost lipsă datorită prezenței repetitive mari în genom. Harta secvențială creată ca rezultat al implementării proiectului include secvențe care conțin în medie câteva milioane de perechi de nucleotide în lungime. Segmentele de această lungime sunt suficiente pentru a suprapune o hartă bazată pe clone pe alte hărți cu o rezoluție mai mică.Poziția pe harta genetică a secvențelor secvențiate a fost de asemenea determinată în raport cu cartografierea STS.

În general, ordonate si asamblate cu ajutorul unor programe de calculator în întinderi de aproximativ 90% regiuni eucromatină ale genomului.

În ciuda incompletitudinea secventiere, un număr obținut cu ajutorul rezultatelor acum este de mare interes. Aceasta se referă în primul rând la aprofundarea noțiunii de organizare a genomului uman.