Les principales dispositions du programme "génome humain"
quand il a créé le programme « Génome humain », les trois objectifs principaux de ce programme ont été identifiés: la création d'une carte génétique précise, la création d'une carte physique du génome humain et le séquençage( détermination) l'ensemble du génome humain.
Création d'une carte génétique du génome
la carte génétique exacte pourrait être créé si les deux conditions suivantes: détecter dans le génome d'un grand nombre de marqueurs génétiques polymorphes( divers) et la présence d'un nombre suffisant de familles pour l'analyse des liens entre ces marqueurs et la mise en place de leur accord mutuel. Le problème des marqueurs génétiques a été résolu après la détection de différents types de polymorphismes de l'ADN.L'ordre de leur introduction à l'analyse génétique a été découvert par polymorphisme de longueur des fragments de restriction( RFLP en abrégé), le polymorphisme en raison d'un nombre variable de répétitions en tandem( VNTR-Polymorphism).Chacun de ces types a ses avantages et ses inconvénients, mais tous ensemble, ils permettent d'étiqueter le génome humain avec une densité très élevée.
Même les 4 premiers types de polymorphismes ont aidé à créer une image génétique du génome humain. Réglez la position relative des marqueurs a permis la collecte, ou la banque, des lignées cellulaires dérivées de tous les membres de quelques centaines de familles, qui comprenait au moins trois générations. Cette banque de lignées cellulaires a été créée en France pour l'étude du polymorphisme dans le système HLA et très utile pour la cartographie génétique du génome humain. Après chaque chromosome a été cartographié et a trouvé la position relative de 10-15 marqueurs polymorphes, en travaillant avec des marqueurs successifs a été réalisée sur un matériau obtenu à partir des membres de ces familles.
Création de cartes physiques du génome Afin de créer une carte physique du génome, les fragments clonés du génome humain a également pour marquer. Cela a été fait par l'intermédiaire de courtes séquences( régions d'ADN avec la séquence déjà défini), que l'on appelle les STS, la localisation chromosomique de ce qui est connu avec précision. STS sont facilement identifiés par réaction en chaîne par polymérase( PCR).Reçu plus de 50 000 STS.dispersés dans le génome, et une cartographie physique est établie lorsque l'agencement mutuel de fragments d'ADN génomique à partir de banques utilisées comme marqueurs STS de chevauchement des segments d'ADN.définition
du
du génome humain Ci-dessous, nous résumons les principaux résultats du « projet de version » du génome humain, qui, comme indiqué ci-dessus, ont été publiés dans le numéro de Février de la revue «Nature» en 2001
terme « projet » fait essentiellement référence au faitque la définition du génome continue. Par conséquent, au moment où il est impossible d'étudier afin de positionner et d'orienter beaucoup de petits ordre séquencée.séquençage incomplet pose naturellement encore des problèmes pour identifier les gènes des maladies héréditaires, des gènes uniques et d'autres structures génétiques.
Il convient de noter que sur le dernier quart du 20ème siècle. Les génomes de 599 virus et autres micro-organismes ainsi que des macro-organismes( animaux) ont été séquencés. L'expérience acquise à la suite de ce travail a été pleinement utilisée dans le séquençage du génome humain.stratégie d'apprentissage du génome humain
dans le projet public comprend l'obtention des cartes génétiques et physiques du génome humain, l'introduction ultérieure de ces cartes résultats de séquençage des clones individuels de l'ADN génomique( séquençage « clone de clone » stratégie).carte physique du génome humain est une base clonale, qui a été développé par des scientifiques Olson en 1981. L'approche est la suivante. Le génome a été coupé en segments par digestion partielle avec des endonucléases spécifiques aux enzymes. Ces grands segments d'ADN ont été placés dans le chromosome bactérien artificiel( BAC) et introduits dans des bactéries, où ils sont copiés à chaque bactérie de la division. En conséquence, des clones de molécules d'ADN identiques ont été formés. De tels clones couvrant le génome humain devraient être d'environ 20 000.
De plus, des cartes STS développées plus tôt ont été utilisées pour établir l'ordre des clones. Le résultat est une carte physique du génome. Les clones de BAC individuels ont été coupés en fragments et clones. Les sous-clones obtenus à la suite de fragments de clonage ont été étudiés. Chaque fois, un grand nombre de sous-clones identiques ont été déterminés pour s'assurer que chaque fragment du clone BAC original a été analysé plusieurs fois et qu'aucune erreur n'a été commise. Les séquences des fragments individuels ont été combinées afin d'obtenir une séquence de nucléotides dans chaque clone BAC initial. Enfin, la séquence du génome entier a été recueillie en combinant les séquences de l'ensemble BAC qui chevauchent le génome entier. La carte ainsi créée de la séquence du génome humain a plus de 1000 discontinuités. Cela peut être dû à un certain nombre de raisons, en particulier le fait que les clones BAC originaux ne chevauchaient pas le génome entier, et le chevauchement entre les clones a été manqué en raison de la présence de grandes répétitions dans le génome. La carte séquentielle créée à la suite de la mise en œuvre du projet comprend des séquences contenant en moyenne plusieurs millions de paires de nucléotides de longueur. Des segments de cette longueur sont suffisants pour superposer une carte basée sur des clones sur d'autres cartes avec une résolution inférieure. La position sur la carte génétique des séquences séquencées a également été déterminée par rapport à la cartographie du STS.
En général, environ 90% des régions euchromatiques du génome sont séquencées et collectées par des programmes informatiques dans des zones étendues.
Malgré l'incomplétude de la séquence, toute une série de résultats obtenus avec son aide est maintenant d'un intérêt certain. Ceci s'applique principalement à l'approfondissement de la notion d'organisation du génome humain.